في 9–10 نوفمبر 2006، استضافت مدينة العلوم بتونس الاجتماع الثاني لتأسيس رابطة المراكز العلمية بشمال أفريقيا والشرق الأوسط؛ حيث وقع خمسة أعضاء مؤسسون مذكرات التفاهم إطلاقًا للرابطة بشكل رسمي. وقد شكل ممثلو الأعضاء المؤسسين الخمسة أول مجلس إدارة للرابطة؛ حيث انتخبت المهندسة هدى الميقاتي – مدير مركز القبة السماوية العلمي بمكتبة الإسكندرية في ذلك الوقت، وتشغل حاليًا منصب نائب مدير مكتبة الإسكندرية – رئيسًا للرابطة.
الأعضاء المؤسسون لرابطة المراكز العلمية بشمال أفريقيا والشرق الأوسط هم:
- مركز القبة السماوية العلمي، مصر
- المركز العلمي بالكويت
- مدينة العلوم بتونس
- مؤسسة المراكز العلمية التركية
- مركز سلطان بن عبد العزيز للعلوم والتكنولوجيا بالمملكة العربية السعودية